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解决方案丨基于10X Genomic平台的单细胞测序自动化方案
[ 发布日期:2023-9-14 8:44:24    阅读次数:406 ]

单细胞测序技术是指在单细胞水平上对核酸分子进行测序的技术。近年来,单细胞测序技术异军突起,成为分子生物学研究的热点,在医学、生物化学、生命科学等领域取得了卓越的成果,也成为了单细胞生态学的重要组成部分。

目前10X Genomics平台是市场上最为常见的单细胞测序平台,基于10X Genomics平台的高通量单细胞测序技术是利用液滴法的原理,使用GemCode技术,通过控制微流体的进入,将带barcode、UMI(Unique Molecular Index,分子标签)、引物及酶的凝胶珠(Gel Beads)与单细胞混合,从而实现大规模的单细胞分离,以及单细胞文库构建的技术。


设备的工作原理:首先将样本制备成单细胞悬液。将制备好的细胞悬浮液利用微流控芯片,将带有细胞标签序列的凝胶珠(bead)和细胞包裹在液滴中。在液滴中,细胞破裂,释放的mRNA与凝胶珠上的细胞标签序列相连,形成单细胞GEMs结构(Gel Bead in Emulsions)。细胞的mRNA在液滴中进行逆转录反应形成cDNA,随后破乳,进行 cDNA 的文库构建。通过文库序列上的细胞标签序列可以区分目标序列来自于哪一个细胞。细胞和反应试剂在微流控芯片上的一条通道中,凝胶珠在另一条通道,共同形成GEM。在每个GEM中独立进行反转录,之后带有标签的 cDNA 将被混合然后扩增再进行文库构建。

使用10X Genomic平台完成对单个细胞的分离与标记后,接下来就是采用NGS技术对标记后的细胞进行测序分析。

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